西博德1796年生於醫學名門。他學醫於Wurzburg大學,但對動物、植物以及民族人類學亦涉獵頗廣。他生性好奇、冒險、犯難,不適開業生活,不久成為殖民大國荷蘭陸軍的軍醫少校,前往今日的印尼首都雅加達。因其才華被上司賞識,1823年被派到位於日本長崎港內名為「出島」的小島上,擔任荷蘭商館的專屬醫師。當時把西學帶入日本的是以荷蘭人帶來的所謂蘭學為主流,長崎一帶已有心想學習西方醫學的日本人士聚集。西博德也就利用時間傳授醫學。
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